Struktur Organisasi SMP Sains Tebuireng

Pengasuh/Ketua Yayasan
Mudir II Bidang Pendidikan
H. Muhammad Hasyim, MA.

Kepala Sekolah
H. Haerul Anam, S.Pd.I

Komite Sekolah
Drs. Wignyo Handoko, M.Si

Wakil Kepala Sekolah Urusan Kurikulum
Abdul Hamid, S.Pd

Administrasi Kurikulum
M. Faris Firdaus, S.Kom

Wakil Kepala Sekolah Urusan Kesiswaan
Anik Muflihah, S.Pd.

Administrasi Kesiswaan
Adam Firmansyah

Wakil Kepala Sekolah Urusan Sarana Prasarana

Nola Mariyah Yuliani, S.Pd

Administrasi Sarana Prasarana

Riza Nur Fikri, S.Hum

Kepala Perpusatakaan 
Naila Nisrina Setya Rahma

Kepala Laboratorium
Achmad Fahrurrozi, S.Pd

Wakil Kepala Sekolah Urusan Humas dan Kepegawaian

H. Mulya Afif, A.Md., S.A., S.Sy

Administrasi Humas dan Kepegawaian

1. Imam El Sadad
2. Apriliyanto
3. Mochammad Ali Adriansyah, S.Kom

Kepala Tata Usaha

Ahmad Fakhruddin Ash S., S.Pd. 

Bendahara

Belinda Ayu Kusuma

Satpam/Keamanan
Mubin

Pengemudi
Anshori Nur Tiktah

Kebersihan
M. Mansur

Pembantu Umum
Suntiani

Tenaga Pengajar

Peserta Didik